Más que termopar, que es muy lento en la respuesta, suelen llevar electrodos de ionización. Por lo que sé, llevan dos bujías en torno al quemador, una cerca de la salida del gas encargada de la ignición (produce un tren de chispas desde ella hacia el quemador que enciende la llama), y otra un poco más hacia arriba y alejada del quemador que actúa como sensor de ionización. Está lo suficientemente alejada como para que la chispa de la bujía de encendido no pueda saltar a ella, pero lo suficiente para que la llama la toque. De este modo, al producirse la llama, y debido a la combustión de elementos orgánicos (butano y propano), esta se ioniza, y al ioinizarse se vuelve parcialmente conductora de la electricidad, de tal modo que como la llama toca las dos bujías, la de ignición y la de ionización, se produce una corriente entre ellas, haciendo que los pulsos de alta tensión del tren de chispas se deriven parcialmente hacia el electrodo superior. De este modo, cuando el sistema electrónico detecta pulsos en el electrodo de ionización, detiene el tren de encendido y pasa a modo mantenimiento, con una corriente menor, de tal modo que si se apagase la llama, desaparecería totalmente cualquier tensión del electrodo de ionización, haciendo que se reactive el tren de chispas para reencender la llama. Y si tras un tiempo X intentando encender llama no se detecta corriente de ionizado, el control corta el gas y apaga el quemador pasando a modo de seguridad.
En tu caso lo más probable es que tengas algún fallo con el electrodo de ionización, aunque si lo tuvieses, el control al no detectar llama aunque la hubiese debería apagar el quemador tras un tiempo de seguridad.