¿Despegar? ¿Eso no va a presión?
Si se despegó y la ventana está bien, podrías volver a pegarlo. A una mala, y ya que estás dispuesto a perder la ventana que tienes, sujétala con tornillos. El taladro con paciencia no tiene ningún misterio. Primero agujereas el aluminio, después pones la ventana y agujereas la ventana (el policarbonato) Luego un tornillo con poca cabeza para que no moleste en la parte interior y una tuerca por el otro lado.
Si intentas taladrar los dos a la vez, puede pasarte que la fuerza que estés haciendo para taladrar el aluminio pase al metacrilato cuando acabes, y así lo partirás.